Methoden - Techniken

Basierend auf immortalen Zelllinien sowie auf aus Geweben gewonnenen Primärzellkulturen bietet die Zellkultur verschiedene Modellsysteme zur Analyse von Zellfunktionen unter dem Einfluss verschiedener Faktoren.

• 2D Zellkultivierung
  Für quantitative Testsysteme zum Nachweis von Proliferation und Toxizität
• Spheroidkultur (3D)
  In vivo-nahe Zellkultur zur Simulation der Tumor-Umgebung
• Primärzellkultur
  Etablierung von Kurzzeitkulturen für genetische/funktionelle Analysen
• Transfektion (siRNA)
  Gezielte Änderung der Genexpression zur Kontrolle der Funktionsänderung
• Ko-Kultur
  Zur Analyse der Zell-Zell Interaktion
• Funktionelle Assays
  Analyse von Proliferation, Migration, Invasion
  Anwendung des Live Cell Analysis Systems: xCELLigence
• Isolation und Charakterisierung von extrazellulären Vesikeln mittels:
  – Ultrazentrifugation
  – Isolations Kits
  – Dichtegradient

Für die umfangreiche Charakterisierung der veränderten Mechanismen der Zellen eines Tumors stehen auf den Ebenen der Genetik, Epigenetik und des Proteoms eine Vielzahl von Methoden zur Verfügung.

• Fluoreszenz in situ Hybridisierung (FISH)
  zum Nachweis von Nukleinsäuren in Zellen, Geweben oder auf Metaphasechromosomen
• Quantitative Polymerase Kettenreaktion (qPCR)
  zur Analyse und Quantifizierung der Expression von DNA, RNA sowie epigenetischer Modifikationen (microRNAs, Methylierung)
• Mikroarray Analysen
  zur Analyse und Quantifizierung der Expression von Genen und Proteinen
• Immunhistochemie / Immunzytochemie
  Visualisierung von Proteinen an Gewebeschnitten oder Zellen
• Polyacrylamidgelelektrophorese (SDS-PAGE)
  gelelektrophoretische Trennung von Proteinen entsprechend ihres Molekulargewichtes
• Western Blot
  Visualisierung von gelelektrophoretisch aufgetrennten Proteinen
• 2D-differenzielle Gelelektrophorese (DIGE)
  gelelektrophoretische Trennung von Proteinen entsprechend ihres isoelektrischen Punktes und Molekulargewichtes im Multiplex-Ansatz